Naukowcy, którzy przebadali koniczynę czerwoną odkryli lecznicze właściwości zarówno w zielu (części nadziemnej rośliny), jak i kwiatach. Wyróżniono w niej pokaźną ilość (około 30) izoflawonów – związków czynnych o leczniczym działaniu. Te wartościowe związki są również określane w medycynie jako fitoestrogeny. Dodatkowo, koniczyna obfituje w:

• fitosterole,
• kwasy fenolowe,
• garbniki,
• taniny,
• witaminę C i witaminy z grupy B,
• olejek lotny.